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“BACs-on-Beads:5所产前诊断实验室的前瞻性研究”点评

时间:2024-08-31

刘鹏飞 王谢桐

(山东大学附属省立医院妇产科,山东 济南 250021)

1 原文摘要

Objective We previously reported on the validation of Prenatal BACs-on-BeadsTMon retrospectively selected and prospective prenatal samples.This bead-based multiplex assay detects chromosome 13,18,21 and X/Y aneuploidies and the nine most frequent microdeletion syndromes.We demonstrated that Prenatal BACs-on-BeadsTMis a newgeneration,prenatal screening tool.Here,we describe the experience of five European prenatal diagnosis laboratories

concerning the ongoing use of Prenatal BACson-BeadsTM.

MethodsSome 1653 samples were analyzed.All results were confirmed by conventional karyotyping or another appropriate technique.All indications for invasive prenatal diagnosis were included.Amniotic fluid and chorionic villus samples were analyzed in equivalent proportions.

ResultsThe failure rate was 3.3%and the overall abnormality detection rate was ~1/10.Eighty-five percent of the detected abnormalities were common aneuploidies.Eleven microdeletions and duplications were identified,thus giving an overall yield for microdeletion and microduplication detection of 1/145.Compared with QF-PCR,Prenatal BACs-on-BeadsTMprovides an additional detection rate of~1/250 for low-risk pregnancies.The false positive and negative rates were both<1%.

ConclusionWhen associated with conventional karyotyping,the Prenatal BACs-on-BeadsTMassay combines a short turnaround time(typical of rapid aneuploidy detection tests)with valuable detection of the most frequent microdeletion syndromes that cannot be detected in cytogenetic analyses.

2 论文核心内容及点评

该论文发表在《Prenatal BACs-on-BeadsTM:the prospective experience of five prenatal diagnosis laboratories》杂志2012年第32卷上,BoBs由PerkinElmer在欧洲推出,是一种用于检测多种遗传性疾病的新型体外诊断技术。该文章对欧洲5家不同的产前诊断实验室进行了一年的实验室研究。这项研究旨在:①描述及评估BoBs应用于常规产前诊断的可行性;②估计这项技术在不同组有创性产前诊断中的额外诊断量;③计算目前的假阳性及假阴性率;④就在产前诊断中其他快速分子检查方法而言,评估其利弊。下面简述该文章主要内容。

传统核型分析是有创性产前诊断的金标准。然而,在过去的20年中,基于非培养性样本的新的快速非整倍体检查得到了快速的发展,并在一些国家进入临床应用,这些实验在48小时之内,为最常见的非整倍体包括13、18、21及X/Y染色体提供检查结果。一项新的基于微球的定向分析—产前BACs on Beads(简称BoBs)得以发展起来。产前BoBs检测是细胞遗传学实验室用于分析影响新生儿及其家庭的重大遗传性疾病相关染色体异常的一种体外诊断新型解决方案。产前BoBs检查可以通过微量DNA样品同时检测多种染色体异常,并在24小时之内获取结果。此外,该技术可同时分析40个以上的样品,从而实现高通量诊断。产前BoBs检测是一种通过CE认证的分子核型分析技术,可实现对相关的基因组区域的DNA扩增和缺失的目标检测。该检测可发现13、18、21、X和 Y 染色体非整倍体,同时还可检测9个微缺失综合征区域的DNA拷贝数的变化情况。使用该检测获取的信息比通过其他常用方法获取的信息更具指导意义。

在此之前基于回顾性选择的和前瞻性的产前样本的产前BoBs应用的报道已经被发表。这篇文章则对来自于五家欧洲产前诊断实验室的实验经过进行了叙述,这项实验对1653例样本进行了分析。应用BoBs进行分析通常只需要150 g DNA,相当于从3~5ml羊水或者一个绒毛获得的量。从取样开始24~48小时之内便可得到结果。所有结果都经过传统核型分析及其他适当手段的证实。所有关于创伤性产前诊断的适应证(B超发现异常、孕妇高龄、唐筛高风险、孕妇焦虑、异常父或母方染色体核型等)都包括在内。羊水及绒毛膜样本以对等的比例进行了分析(其中,绒毛膜样本的检出率为1/8,高于羊水样本的检出率1/13)。研究结果显示其失败率为3.3%,文章进一步分析其失败的主要原因包括DNA样本含量低及技术操作不当等。总体来说异常检出率为1/10,其中常见的非整倍体(21三体所占比率最高,其次是18三体)占到了被检测到的异常情况的85%。其假阳性率及假阴性率均低于1%。此外,还有11种微缺失或重复得到了证实,从而使全部微缺失及微重复的检出率达到1/145。与QF-PCR相比,产前BoBs所用时间略长,但获得信息更多,增加了针对于血清学筛查低危孕妇的1/250的检出率,使得BoBs具有更高的效价比及诊断价值。

同时,该文章认为,由于该项技术的稳健性及多功能性使得这一技术适于向缺少细胞遗传学实验室的发展中国家引进,从而使得患者得以进行非整倍体诊断及大部分亚显微拷贝数变异的检测。

该文章为我们产前诊断工作介绍了一种新的方法,这种方法已经在欧洲开始应用。该方法不仅可以检测常见的非整倍体异常,而且可以检测一些常见的微缺失综合征,是新一代的产前筛查方法。

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