时间:2024-09-03
胡美容,陈鸿军,于圣青,谭 磊,仇旭升,高 崧,丁 铲*
(1.扬州大学兽医学院,江苏 扬州 225009;2.中国农业科学院上海兽医研究所国家家禽工程技术研究中心,上海 200241;3.国家家禽工程技术研究中心,上海 200331)
鸡毒支原体(Mycoplasma gallisepticum,MG)感染引起的慢性呼吸道疾病(Chronic respiratory disease,CRD)是造成养鸡业严重经济损失的主要疾病之一[1-2]。确定毒力因子是研究MG的致病机制的关键[2]。然而,除了丝状支原体丝状亚种、关节炎支原体、和肺炎支原体等少数种类以外,大多数支原体目前尚未发现质粒存在[3],大部分基于质粒的基因操作工具不适用于支原体,从而限制了MG毒力基因的研究[4]。最近,人工改造的mini-Tn4001在该支原体中得到应用[5-6],但是转座子在基因组中插入位点具有随机性,对靶向基因缺失的筛选工作量大,并且随机插入往往使基因表达分析变得更加混淆[7]。
为了使构建的同源重组质粒在支原体内稳定存在,提高靶向基因的缺失效率,构建的载体需在支原体中可连续复制。一些可复制载体已在上述含有质粒的几种支原体中被使用,主要是基于测序的支原体染色体复制原点(oriC)进行构建,但在不含质粒支原体中这种载体的应用尚不多见[3,8-12]。由于oriC具有严格的宿主特异性,Rohini等构建了无乳支原体的穿梭质粒[13];Lee等基于MG oriC原点构建可复制性载体,这些质粒在模拟支原体(M.imitans)和MG染色体外可以自行复制,利用同源重组使vlhA基因失活[7],但该载体可以在支原体的oriC区域出现整合,并且难以稳定传代。
本研究基于上述研究结果,构建基于MG oriC部分活性区域的可复制型载体,并且可以在MG中稳定存在、在传代过程中整合几率低,为研究利用该载体进行毒力基因的靶向缺失研究奠定基础。
1.1 细菌和质粒 MG Rlow强毒株为本实验室保存(液体培养基中传代小于10代);pBluescript-SK(+)载体购自Clontech公司;Bactobac杆状病毒穿梭载体pFAST-Bac1购自Invitrogen公司;mini-Tn4001 GmR载体为含有mini-Tn4001和编码庆大霉素乙酰转移酶的aacC1基因完整ORF(包含启动子部分)的MG通用转座载体为本实验室构建并改造[5]。
1.2 主要试剂 质粒DNA提取试剂盒、凝胶回收DNA试剂盒均购自德国QIAGEN公司;限制性内切酶均购自宝生物工程(大连)有限公司;T4 DNA连接酶均购自美国Promega公司;ATCC 243号支原体培养基Bacto心浸肉汤、琼脂粉均购自BD公司;灭活马血清和猪血清购自Gibco公司。
1.3 MG DNA提取 MG Rlow株生长于预热的完全培养基中(含10%灭活马血清+10%猪血清+10%新鲜酵母浸液),于5%CO2培养箱静置培养3 d或摇床中培养16 h至对数生长期。将培养液12000 r/min 10 min,沉淀以 0.01 M PBS洗涤 3次,用 50 μL 0.01 M PBS悬浮,煮沸10 min,高速离心10 min,取上清,测定DNA含量,-20℃分装保存。
1.4 MG oriC部分片段的扩增 根据MG oriC假定区域(图 1)和 MG Rlow株 oriC基因序列[14],设计oriC短区的引物(表1),引物两端分别加入XbaⅠ、BamHⅠ相应的酶切位点。PCR反应条件:95℃5min;94℃1 min、50℃ 45 s、72℃1 min,30个循环;72℃10 min。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳,经回收后,与pGEM-T载体连接,转化,筛选阳性克隆,测序。测序序列与MG Rlow株全基因(NC-004829)oriC同源区域进行比对。测序正确后经双酶切连接pBluescript-SK(+)载体,筛选阳性重组质粒,命名为pBSoriC。
1.5 庆大霉素抗性基因的扩增 根据编码庆大霉素乙酰转移酶的aacC1基因参考序列,设计特异性引物,在上游引物的5'端添加MG TufA蛋白的强启动子序列[15](TTTAGGGGTGTAGTTCAA)(表1)。以pFAST-Bac1载体为模板,扩增aacC1基因。
表1 引物序列Table 1 Primer sequences
1.6 可复制载体的构建 将上述扩增得到的PCR产物经HindⅢ酶切,与同样酶切处理的pBSoriC载体4℃连接过夜,转化,挑取阳性克隆测序鉴定,将其命名为pBSoriC-GmR。将该载体转化DH5α,涂布含100 μg/mL庆大霉素的LB平板,检测庆大霉素的活性。并与mini-Tn4001GmR载体进行对比。
1.7 电转化及抗生素筛选 采用无内毒素的质粒DNA试剂盒提取pBSoriC-GmR重组菌质粒DNA,测定DNA纯度及含量,分装冻存于-80℃。电转化条件同文献[5]~[7]报道。取150 μL电转化培养物涂在含有100 μg/mL庆大霉素的ATCC固体培养基中,置于37℃,5%CO2培养5 d~7 d。
将MG单菌落接种于不含庆大抗生素的ATCC培养基中,37℃,5%CO2培养3 d~5 d后,取发生颜色变化的单克隆培养物200 μL提取基因组DNA,用 aacC1引物(gen-Fwd2/gen-Rev2)进行 PCR鉴定。另取200 μL转接种到含有100 μg/mL庆大霉素的ATCC培养基中,观察其能否继续传代。
1.8 庆大霉素乙酰转移酶鼠多抗的制备 采用aacC1基因引物(gen-Fwd2/gen-Rev2)扩增,连入pET-28a(+)载体中,转化BL21(DE3)宿主菌,用0.5mM IPTG诱导表达。超声波裂解(400 w,工作时间5 s,间歇时间5 s,99次),12000 r/min离心15 min,收集上清和包涵体进行SDS-PAGE检测,纯化表达产物。将纯化的庆大霉素乙酰转移酶蛋白样品免疫6周的BALB/c小鼠,免疫剂量为100 μg/只,四免后采血检测。
1.9 Western blot检测 取5 mL对数生长中后期的的各电转化单克隆菌落的二代培养物,进行SDS-PAGE电泳,转印至PVDF膜,5%脱脂乳封闭,一抗为1∶103稀释的庆大霉素乙酰转移酶鼠多抗血清,二抗为HRP标记羊抗鼠IgG,1∶104稀释,37℃作用2 h,洗涤后,用DAB显色试剂盒显色。
2.1 可复制载体的构建 根据MG的全基因组测序结果,预测的oriC区域主要分为长区和短区,其中,oriC短区位于soj基因和dnaA基因之间(图1)。扩增获得oriC短区大小为670 bp(图2A)。将该片段克隆入pBlueScript SK(+)载体中,命名为pBSoriC。再将编码庆大霉素乙酰转移酶的aacC1基因(图2B)亚克隆入该重组质粒中,经测序构建获得pBSoriC-GmR 载体(图 3)。
图2 MG oriC短区片段和aacC1基因PCR结果Fig.2 PCR results of MG oriC short region andaacCIgene
2.2 可复制载体tuf启动子活性检测 将pBSoriCGmR和mini-Tn4001GmR载体分别转化DH5a,涂布含100 μg/mL庆大霉素的LB平板,检测细菌生长情况,对比阳性对照mini-Tn4001GmR,耐药基因启动子为aacC1基因本身的启动子,而pBSoriC-GmR载体的aacC1基因是由tuf启动子启动的庆大霉素耐药基因,转化结果显示在抗性平板中两种载体转化的重组细菌均生长良好,而对照pBSoriC重组菌无细菌生长(图4)。
图3 pBSoriC-GmR模式图Fig.3 pBSoriC-GmR model chart
图4 tuf启动子活性检测Fig.4 Activity detection of tuf promoter
2.3 MG电转化及PCR鉴定结果 经电转化和抗生素筛选,在显微镜下挑取固体平板中生长良好的MG单菌落,共100株,经液体培养,取发生颜色变化的单克隆培养物200 μL提取基因组DNA,用aacC1引物(gen-Fwd2/gen-Rev2)进行PCR鉴定。结果显示第66和78号单克隆呈阳性反应(图5)。
图5 电转PCR鉴定结果Fig.5 Identification results of transformants
2.4 转化子稳定性鉴定 分别取200 μL两株单克隆转接种到5 mL含有100 μg/mL庆大霉素的ATCC培养基中,继续传20代。66号转化子传到第4代时无法在含有100 μg/mL的庆大霉素培养基中继续生长。78号转化子在庆大霉素浓度为250 μg/mL的液体培养基中仍能成长良好,目前已传至22代。
为检测tuf启动子启动庆大霉素抗性基因的活性,以鉴定该载体是否可以表达外源基因,本实验利用原核表达系统可溶性表达庆大霉素乙酰转移酶(图6A),制备获得小鼠多抗血清。利用获得的庆大霉素乙酰转移酶多抗血清,对电转化的78号单克隆传代培养产物进行western blot检测,结果显示该克隆第4、10和22代培养产物均高效表达该庆大霉素抗性基因(图6B),表明该载体在MG中稳定传代。
图6 庆大霉素乙酰转移酶表达的SDS-PAGE及western blot检测结果Fig.6 Detection of gentamicin acetyltransferase expression by SDS-PAGE and western blot
MG的Rlow和F株全基因组序列的公布为功能基因的研究提供了便利条件[14,16],然而,对于肺炎支原体、生殖支原体和MG而言,至今未发现任何质粒存在,并且对外源质粒载体不兼容,基于质粒载体的基因操作手段无法在该类支原体中有效开展[7]。虽然利用具有四环素抗性基因筛选的Tn916和Tn4001转座子能够在MG中转座,但由于存在基因组太大和插入位点的随机性等缺点,给深入研究带来的诸多不便[5-6,17-19]。
Janis等发现丝状支原体丝状亚种存在质粒,这些质粒仅具有复制功能[9]。在构建可复制载体过程中,大肠杆菌的复制原点在丝状支原体初次传代时容易丢失。而基于支原体染色体的复制原点构建的人工质粒载体,可使外源基因在支原体中稳定存在。Cordova等利用鼠肺支原体的oriC构建成穿梭载体pMPO1载体,含dnaA基因及DnaA复制起始蛋白及上下游序列[20]。该载体能在大肠杆菌及肺炎支原体之间穿梭,并可在肺支原体中复制,但几代后出现整合入染色体oriC区域的现象。为了避免整合,提高稳定性,dnaA基因从oriC区域中去除,替代为tetM基因。pMPO5载体至少可以在液体培养物中传15代,经检测该载体未整合入基因组。
在大多数的细菌中,oriC都位于dnaA基因区域内。Papazisi L等推测MG oriC区域位于dnaN和dnaA之间,oriC区域含5个DnaA表达盒序列,并且每一个DnaA盒均具有保守的9nt序列(5'-TTW TMHAMA-3'),在dnaN和soj区域间富含AT高达80%,整个区域长度为3.16 kb[14]。在早期的研究中,基于oriC构建的重组质粒均包含一个较大的oriC区域,包含有多个dnaA和soj基因,这一载体极易整合入基因组DNA的oriC区域[3,11-12,21]。Lee等基于MG oriC原点构建可复制性载体,并将oriC分为长区和短区,大小分别为:1889 bp和670 bp[7]。这些质粒在模拟支原体(M.imitans)和MG染色体外可自行复制,利用同源重组成功使vlhA基因失活。但这一载体仍在支原体的oriC区域易整合,并且难以稳定传代。
研究表明柠檬螺原体的可复制载体的oriC序列仅包含dnaA基因下游163 bp,该区富含AT,而不包含soj基因。为了构建能够在MG中稳定存在的可复制性载体,并降低该载体整合入基因组的几率,本研究构建了MG oriC部分区域(短区)的重组质粒,而该区在soj基因下游,包含两个DnaA表达盒,无AT富集区。经电转化鉴定,该oriC序列可以作为oriC稳定复制,并在MG中稳定存在22代以上,并高效表达庆大霉素乙酰转移酶。这表明该载体在MG中可以相对稳定地高效表达外源基因。这一结果为利用MG作为表达载体奠定了良好基础。下一步的研究将在该载体中插入其他病原体的保护性基因,并对目的基因进行适当修饰,以利于表面定位,增强免疫原性。
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