将140年的计算量缩短为1天完成

张伟

H1N1型流感病毒正在多个国家肆虐,确诊患者数目的每一个变化都牵动着全球数十亿人民的心。医疗研究人员正积极寻找治疗流感新药,但这些药品研究需要的计算量非常庞大,可能要花上相当长时间。IBM全球网格大同盟(WCG)近日与美国德州大学医学院启动了“研究流感病毒计划”的实验室项目,可极大加速新的抗流感药物的研制进度。

WCG利用成熟的网格技术可使用海量的志愿注册设备的闲置计算资源,进行虚拟化学实验,确定几百万小分子中哪些可以附着到流感病毒上并阻止其传播。目前,全世界已经有45万志愿者加入WCG,注册计算机超过120万台。据统计,WCG整合所有注册设备的计算资源,平均每个日历日期运行的时间相当于140多年。

德州大学医学院副教授兼研究组长Stan Watowich博士说:“由于在IBM全球网格大同盟上进行抗登革药项目,获得了很多宝贵经验,我们有望在不到一个月的时间里找到新的抗流感药并进行测试。”

“现在,任何拥有可以上网电脑的人都可以为解决这一关键的健康隐患问题提供解决方案。”IBM大中华区公众事业合作部总经理郭维德表示。任何机构或个人均可为该项目志愿贡献自己电脑闲置的计算能力。志愿者注册后,在电脑上安装一个免费、安全、无侵害性的软件程序。WCG把研究任务分割成不计其数的可同时处理的微型片断,自动分配给各个志愿者。当志愿者电脑待机或计算负载较低时,该软件就会从WCG的服务器请求数据,并使用这些数据进行药物探索计算,完成后把结果反馈给服务器,再请求新任务。据IBM大中华区公众事业合作部项目经理张红捷介绍,由于代理软件占用的资源十分有限,因此不会影响计算机的运行速度,而且它的安全性十分有保障,志愿者无需顾虑。“研究流感病毒计划”一开始,IBM中国公司就号召全体员工及业务合作伙伴单位加入WCG的项目,短短两天内就有数百位人员加入该计划,且还在增长中。

WCG项目启动于2004年11月,已经或者正在进行的研究项目包括:全球营养水稻、非洲气候研究、帮助征服癌症、对抗艾滋病、联手寻找治疗登革热药物等项目。今年WCG又增加了治疗儿童癌症、研究抗流感药品、治疗肌肉萎缩症三个项目。目前共有13个项目在WCG上运行。

WCG设有顾问委员会,由国际上从事健康科学、技术和慈善事业的专家组成,他们会对研究项目申请进行审查。据张红捷介绍,审查标准主要有两条:第一,项目必须对人类有益,且为公益性质;第二,项目需要大量计算,而研究者本身没有超级计算机或相应的计算能力。网格计算虽然已经是成熟的技术且有不少应用,但WCG是全世界唯一一家完全公益且同时运行多个研究项目的网格平台。据悉,WCG网站上现在有5种语言版本,中文版于2008年6月底上线。目前为止,中国志愿者有3000多人,注册计算机4500多台。