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鄂尔多斯地区蒙古族人群SLCO1B1和ApoE 基因多态性的研究

时间:2024-05-15

陈晓晓,段宝生

(1.包头医学院,内蒙古 包头 014000;2.鄂尔多斯市中心医院,内蒙古 鄂尔多斯 017000)

0 引言

SLCO1B1基因位于12号染色体上,它包含15个外显子和14个内含子[1],SLCO1B1有40多种单基因核酸多态性,但4号外显子区388A>G和5号外显子区521T>C是两种常见的单核苷酸多态性位点,形成四种单倍型*1a、*15、*1b、*5,其编码转运蛋白OATP1B1,主要介导肝细胞对内源性化合物和临床药物的吸收,从而影响物质在血浆中的浓度及药物活性,与他汀类药物致患者横纹肌溶解和肌病等药物副作用密切相关[2]。人类ApoE基因位于第19号染色体长臂上,包含4个外显子与3个内显子[3],ApoE基因有ɛ2、ɛ3、ɛ4三种等位基因。可形成6种可能的ApoE基因型。ApoE介导动脉粥样硬化相关细胞的胆固醇逆向转运过程,对动脉粥样硬化的衰减有一定作用[4]。它也是许多大脑淀粉样蛋白-β沉积的组成部分,包括阿尔茨海默病中的淀粉样蛋白-β沉积,从而影响阿尔茨海默病的发病与发展[5]。本研究通过实验检测,了解鄂尔多斯地区蒙古族老年人群SLCO1B1和ApoE基因多态性分布情况,为该地区蒙古族人群基因遗传学、心脑血管疾病和阿尔茨海默病的预防、服用他汀类药物疗效和致肌病风险评估提供理论依据。

1 资料与方法

1.1 一般资料

选取2019年10月-2021年1月在鄂尔多斯市地区多家医院健康体检的蒙古族老年人群120名作为研究对象,纳入对象均为三代内纯蒙古族人群,平均年龄为(63.41±6.99)岁,其中男性64名,女性56名。

1.2 主要试剂与仪器

血液基因组DNA提取试剂盒、人类SLCO1B1和ApoE基因检测试剂盒、罗氏480实时荧光定量PCR仪器。

1.3 研究方法

纳入对象晨起空腹采血于真空紫头采血管中,于-80℃超低温保存箱中保存,定期提取血样DNA后检测其基因型。

1.3.1 提取血样DNA

①取200μL血样于离心管中;②加入20μL蛋白酶K;③加入200μL GB,70℃干式加热10min;④加入200 μL无水乙醇;⑤液体转入CB3吸附柱里,离心去液;⑥加入500μL GD,离心去液;⑦加入600μL PW,离心去液;⑧重复操作⑦;⑨离心放置;⑩将CB3吸附柱放入离心管中,滴加100μL TE,放置后离心,所得溶液即为DNA提取液。

1.3.2 PCR 扩增

①本试剂盒检测4个单核苷酸位点的4种反应液,每个八连管孔中分别加入23μL反应液;②样本准备:将待测液、质控品分别取2μL加入已装有反应液的八连管中;③结果判定:上机后根据荧光信号通道扩增曲线判读基因型。

1.4 数据处理

将鄂尔多斯地区蒙古族老年人群的SLCO1B1和ApoE基因型分布进行遗传平衡评估,检测本研究纳入的健康体检人群SLCO1B1和ApoE基因型分布是否满足Hardy-Weinberg定律。

2 实验结果与分析

(1)鄂尔多斯地区蒙古族老年人群的SLCO1B1和ApoE基因型、等位基因的分布,如表1、表2。

表1 SLCO1B1基因型和等位基因分布(n)

表2 ApoE基因型和等位基因分布(n)

(2)将纳入人群基因型进行Hardy-Weinberg平衡定律分析,采用x2检验可知,本研究纳入的鄂尔多斯地区蒙古族老年人群样本SLCO1B1和ApoE基因型分布均满足Hardy-Weinberg定律,数据具有代表性。

(3)在鄂尔多斯地区蒙古族老年人群中,SLCO1B1基因型分布频数由大到小依次为*1a/*1b>*1b/*1b>*1b/*15=*1a/*15>*1a/*1a>*15/*15>*1a/*5>*5/*5=*5/*15;等位基因*1b>*1a>*15>*5。ApoE基因型分布频数由大到小依次为ɛ3/ɛ3>ɛ3/ɛ4>ɛ2/ɛ3>ɛ4/ɛ4>ɛ2/ɛ4>ɛ2/ɛ2,等位基因ɛ3>ɛ4>ɛ2。

(4)纳入人群的SLCO1B1基因多态性分布评估他汀类药物致肌病风险。如表3。

表3 SLCO1B1基因多态性分布特点[n(%)]

SLCO1B1基因多态性与他汀类药物致患者横纹肌溶解和肌病密切相关[6],目前根据他汀类药物不良反应和肌病风险等,可将SLCO1B1基因多态性分为正常肌病风险型(*1a/*1a、*1a/*1b、*1b/*1b)、中度肌病风险型(*1a/*5、*1a/*15、*1b/*15)和重度肌病风险型(*5/*5、*5/*15、*15/*15)3种表型[7],根据鄂尔多斯地区蒙古族老年人群SLCO1B1基因多态性频数分布情况,可计算得到:正常肌病风险型、中度肌病风险型、重度肌病风险型的人群所占比例分别为75.83%、22.50%、1.67%。因此可推测在鄂尔多斯地区蒙古族老年人群中,大部分人群服用他汀类降脂药物为正常肌病风险、少数人群为中度肌病风险、极少数人群为重度肌病风险。

(5)纳入人群的ApoE基因多态性分布评估患心脑血管疾病和阿尔茨海默病风险、服用他汀类药物降脂的疗效,如表4。

表4 ApoE 基因多态性分布特点[n(%)]

ApoE基因多态性因被分为:降脂疗效良好、患心脑血管疾病和阿尔茨海默病低风险型(ɛ2/ɛ2、ɛ2/ɛ3);降脂疗效正常、患心脑血管疾病和阿尔茨海默病中风险型(ɛ2/ɛ4、ɛ3/ɛ3);降脂疗效降、低患心脑血管疾病和阿尔茨海默病高风险(ɛ3/ɛ4、ɛ4/ɛ4)三大类,根据鄂尔多斯地区蒙古族老年人群ApoE基因多态性频数分布情况,可计算得到:降脂疗效良好患病风险低型、降脂疗效患病风险正常型、降脂疗效差患病风险高型人群所占比例分别为5.00%、80.83%、14.17%。因此可推测鄂尔多斯地区蒙古族老年人群大多数服用他汀类降脂疗效患病风险正常型,较少数人群服用他汀类降脂疗效差患病风险高,少数人群服用他汀类降脂疗效良好患病风险低。

3 讨论

由于受种族、遗传背景、地理环境等多方面差异因素影响,根据现有文献可知,目前关于SLCO1B1和ApoE基因多态性分布在不同民族及地区之间存在差异,王新利等提出在新疆地区的维吾尔族人群和汉族人群ApoE基因均以ε3/ε3基因型最常见,但维吾尔族人群较常见基因型为ε3/ε4型,汉族人群较常见基因型为ε2/ε3型[8],郭启燕等提出,贵州省黔南州毛南族人群ε4等位基因最常见,毛南族人群ε4等位基因频率明显高于广西壮族人群和云南傣族人群[9],因此研究对象的民族差异会导致结果有明显差异,而鄂尔多斯地区蒙古族老年人群作为喜食高油脂肉类的少数民族,其与汉族人群存在显著民族差异和饮食差异,因此探讨鄂尔多斯地区蒙古族老年人群SLCO1B1和ApoE基因多态性分布情况[10-13],为该地区蒙古族人群基因遗传学、心脑血管疾病和阿尔茨海默病的预防、服用他汀类药物疗效预估及致肌病风险提供理论依据。

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