《柳叶刀》新型冠状病毒肺炎案例分析两则

PART1.感染病例分析

1.患者特征逐渐明朗

本次的研究为回顾性分析，患者均为在今年1月1日至1月20日。在武汉金银潭医院接受治疗的确诊患者。分析表明，有49名患者曾有华南海鲜市场的暴露史，占比为49%。其中，有47名患者具有长期暴露史（大部分为市场销售人员或市场管理人员），2名患者只有短期暴露史（顾客）。

从患者的性别和年龄特征上看，本次分析的病例中，男性占了多数，共67名（68%）。这一比例与之前的数据（73%）相当。而从年龄分布上看，最新数据的年龄中位数为55.5岁，较先前的49.0岁有所上升。

世界卫生组织在上周的新闻发布会中多次提到，这次的感染病例中，有不少具有基础疾病。本次的分析结果与这一观点具有一致眭。分析表明。在这99名患者中。有50名患者同时具有心血管疾病、内分泌系统疾病、消化系统疾病等慢性疾病，占比约为51%。这些基础疾病可能削弱了他们的免疫系统。

这些分析结果表明，新型冠状病毒更有可能感染那些具有慢性疾病（免疫功能较弱）的年长男性。

2.症状与治疗

论文中作者们也介绍了这些患者的常见症状和常用的治疗方案。数据表明，有83%的患者出现了发热，82%的患者有咳嗽。这两者是最为常见的临床特征。相比之下，其他的一些疾病特征则相对比较少见——有31%的患者出现了气短，11%的患者出现了肌肉疼痛，这些都没有超过半数。而剩余的一些症状，则占比不超过10%。

在治疗方面，大约四分之三的患者（76%）接受了抗病毒疗法。《柳叶刀》论文介绍说，患者使用的药物包括奥司他韦

（oseltamivir）、更昔洛韦（ganciclovir），以及最近引起广泛关注的抗HIV感染疗法洛匹那韦/利托那韦（lopinavir/ritonavir）。

与此同时，有70%的患者接受了抗生素治疗，有15%的患者接受了抗真菌治疗。这些是为了应对患者出现的其他感染。

3.其他讨论

作者们根据数据，做了一些相关的讨论。首先，他们讨论了一些“未知”。我们知道，无论是SARS病毒，还是MERS病毒，都从蝙蝠身上起源，且经过中间宿主传染到人类。然而目前我们还不清楚，本次新型冠状病毒的来源究竟是何方。另外，病毒的具体传播率也依然不得而知。

其次，他们讨论了感染的死亡率。从本篇论文的数据来看，99名患者中，有11名在论文发表时已经死亡，死亡率为11%。这一死亡率与SARS感染相当（10%），但不如MERS感染那么严重（35%）。作者也指出，随着时间的推移，正在住院的患者中，可能还会有新增的死亡病例。

而从卫生應急办公室发布的最新公告来看，31个省（区、市）的累计死亡率为2.2%，现有的重症病例率为20.7%。

作者们还根据实验室检测的结果，指出大部分患者的淋巴细胞计数有所降低。这可能是因为在感染之后，体内的细胞因子风暴引发了一系列免疫反应，导致淋巴细胞的数量发生变化。这些结果表明本次新型冠状病毒可能会影响到淋巴细胞，与SARS类似。而较低的淋巴细胞计数，或许也可以成为临床诊断的参数之一。

4.小结

本篇论文的样本数虽有增加，但和总确诊病例相比，依然较少。此外，疑似病例的情况也尚未考虑在内。这些信息只能让我们窥见新型冠状病毒感染的早期特征。我们也期待随着更多分析结果的出炉，科研人员和医务人员们能更好地了解这种疾病，更好地对其进行诊治和防控！

PART2.基因组分析

1.与舟山蝙蝠病毒最接近

在这项研究中，科学家们从9名患者的支气管肺泡灌洗液与培养物中分离出了样本，进行基因测序工作。从这些样本中，科学家们一共拼接出了8个完整的病毒基因组，以及2个部分完整的病毒基因组。

在获得了这些基因组信息后，研究人员们首先比对了它们之间的基因序列。比对结果表明，这8个完整的病毒基因组高达99.98%，几乎完全一致！考虑到病毒本身较容易突变，这个比对结果告诉我们，从病毒感染人体到医务人员对病毒进行系统性的检测，这中间相隔的时间极短。

那么。这些病毒从何而来呢？作者们将其他已知的冠状病毒基因组也纳入了比对的范畴，这也包括了知名的SARS病毒和MERS病毒。比对结果表明，与新型冠状病毒完整基因组序列最为接近的，是2018年在浙江省舟山市的蝙蝠体内分离出的两株病毒，相似性达87.99%。相比之下，新型冠状病毒与SARS和MERS病毒的序列就没那么相像，相似性分别为79%和50%。

2.基因序列说明了什么？

在进一步的分析中，这些病毒的基因组序列向我们透露了更多细节。先前对于冠状病毒的研究表明，其表面的S蛋白在病毒的感染和传播上有着非常重要的作用。S蛋白可以分为两部分：一块叫做S1亚基，负责和细胞表面的受体结合;另一块叫做S2亚基，负责“钻”入细胞。

前面我们提到，与舟山蝙蝠体内发现的两株冠状病毒相比，此次新型冠状病毒的基因组序列相似性很高。而在S蛋白上，科学家们则看到了一个很有意思的现象——负责“钻”入细胞的S2亚基，与蝙蝠病毒的相似性达到了93%;而负责识别细胞受体并与之结合的S1亚基，相似性则只有68%。这也表明在感染人类上，新型冠状病毒可能有着其特殊性。

那么，这种病毒究竟结合的是什么受体呢？研究人员们发现，尽管与SARS病毒总体而言相似性不是那么高，但在S1亚基上，两者却有着不少保守的氨基酸。基于这些结果，辅以计算机模型，研究人员们猜测新型冠状病毒可能和SARS病毒一样，结合的是人体的ACE2受体。但他们也指出，一些SARS病毒用于和ACE2结合的氨基酸位点，却在新型冠状病毒中发生了变异。因此它也有可能结合我们目前未知的某种受体。

3.其他讨论

在分离用于测序的样本时，科研人员们也对患者的来源进行过汇总。这9名患者中，有8名在华南海鲜市场有着暴露史，表明他们有可能是在市场内接触到了感染源。然而，第9名患者却从未去過华南海鲜市场，如何感染病毒尚不明确。

作者们做了两种可能性的分析。首先，由于这名患者曾住在华南海鲜市场附近的宾馆，可能通过飞沫传播，感染上了这种病毒;又或者，这名患者体内的病毒来自某个目前还不明确的来源。现在，我们无法区分这两种可能性。

《柳叶刀》表示，新型冠状病毒和蝙蝠中分离出的病毒序列最为相似，但不大可能直接由蝙蝠传染给人类，理由如下：首先，去年12月，我们才听到有感染病例的消息，而武汉的蝙蝠在当时大部分已进入冬眠;其次，华南海鲜市场中并没有发现贩售蝙蝠的现象，相反，很多“非海鲜”的动物却见在其中贩售，包括可能作为中间宿主的哺乳动物;再次，尽管新型冠状病毒的序列和蝙蝠中分离出的序列最为相似，但两者的相似程度依旧不到90%，表明舟山的蝙蝠体内找到的病毒，不大可能是本次疫情的直接病毒来源，相反，现有的病毒应来自其他的来源;最后，我们已知的两种严重的冠状病毒SARS和MERS，虽然最初的病毒储存库都是蝙蝠，但均通过中间宿主传给人类。

综合来看，研究人员们认为，本次新型冠状病毒可能最初也同样来自某种蝙蝠，然后通过某种在华南海鲜市场贩售，目前还未知的野生动物，传染给了人类。作者们也在文章的最后指出，本次疫情的暴发，再次强调了野生动物体内未知病毒对人类的潜在威胁。