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分子改良提高甘露聚糖酶的耐热性

时间:2024-05-23

王亚伟 薛强 熊海容

摘要:以来源于嗜热放线菌(Thermobifida fusca)的甘露聚糖酶基因(KJ806638)为研究对象,利用易错PCR方法对其进行改造,获得了耐热性进一步提高的甘露聚糖酶。筛选获得的N16I突变株,其最适反应温度从72.5 ℃提升到77.5 ℃。差示扫描荧光定量(DSF)检测结果显示,酶蛋白质的表观解链温度Tm从61.9 ℃提升到 63.2 ℃。

关键词:甘露聚糖酶;易错PCR;热稳定性

中图分类号:Q55         文献标识码:A

文章编号:0439-8114(2023)12-0151-03

DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2023.12.027 开放科学(资源服务)标识码(OSID):

Improving the thermotolerance of mannanase through molecular improvement

WANG Ya-wei1,XUE Qiang2,XIONG Hai-rong2

(1.School of Life Science and Technology,Wuhan Polytechnic University,Wuhan  430048,China;

2. College of Life Sciences, South-Central Minzu University, Wuhan  430074,China)

Abstract:The mannanase gene (KJ806638) from Thermobifida fusca was used as the research object, and it was modified by the error-prone PCR method, and the heat resistance of mannanase was further improved. The optimum reaction temperature of N16I mutant was increased from 72.5 ℃ to 77.5 ℃. Differential scanning fluorometry (DSF) testing results showed that the apparent decomposition temperature Tm of the enzyme protein increased from 61.9 ℃ to 63.2 ℃.

Key words: mannanase; error-prone PCR; thermostabilty

甘露聚糖酶是一种半纤维素酶类[1],现已被广泛应用于饲料、造纸、洗涤剂、食品和石油开采及生物质能源等领域,尤其在功能性低聚糖制备和添加剂等方面应用前景十分广阔。在饲料行业,甘露聚糖是饲料中主要抗营养因子之一,会增加食糜在畜禽消化道内的黏度,导致畜禽对饲料中营养物质的消化吸收受到影响,致使饲料的消化利用率降低[2]。在石油方面,甘露聚糖酶常被用作压裂液的破胶剂,可以增强压裂液的导流能力,减少破坏性物质的残留,从而提高产油量[3]。在造纸过程中,甘露聚糖酶可用作处理纸浆的漂白剂,可以有效促进木质素的降解而保留纤维素[4]。

工业生产过程中,往往存在高温等极端环境,高温环境能加快酶促反应速度,提高液体物料的流动性能,防止有害微生物在过程中的生长繁殖等[5,6]。普通中温甘露聚糖酶在高温下会发生结构变化,从而大幅度地丧失活性。来源于嗜热放线菌(Thermobifida fusca)的耐热甘露聚糖酶[7]进行水解,能从根本上解决高温环境使加入的酶很快失活的问题。

易错PCR技术[8]是在正常PCR技术上演变而来的,它是一种使DNA在复制扩增过程中更容易出现错误配对的PCR技术,因此又称为错配PCR或倾向错误PCR。易错PCR通常是利用低保真度的Taq DNA聚合酶和改变一些PCR反应体系等手段,来降低PCR过程中DNA复制的保真度,使错配率升高,从而得到与原来不同的DNA序列或基因。将该酶基因序列通过易错PCR突变后,通过表达和酶特性鉴定后筛选,获得的更高耐热性的甘露聚糖酶突变体4号,在饲料添加剂、保健食品、造纸、洗涤、酿造、纺织和医药等领域具有广阔的应用前景。

1 材料与方法

1.1 菌株质粒和试剂

大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)、质粒pET-22b(+)均为实验室保藏,质粒pAOhr-ManB来源于武汉擎科生物科技有限公司合成。限制性内切酶、Taq酶、Pyrobest DNA聚合酶、T4 DNA连接酶等工具酶购自TaKaRa公司;DNA纯化试剂盒购自爱思进生物技术有限公司。IPTG、X-Gal、SDS及角豆胶购自Sigma公司,TEMED、过硫酸铵、丙烯酰胺、甲叉双丙烯酰胺为国药试剂。

50 mmol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液:取7.10 g磷酸氢二钠溶解于800 mL去离子水中,用柠檬酸调节pH为4.0~7.5范围内任一值后,定容至1 L。50 mmol/L Tris-HCl缓冲液:取6.06 g Tris溶解于800 mL去离子水中,用1 mol/L HCl調节pH至7.5~9.0,定容至1 L。50 mmol/L 甘氨酸-氢氧化钠缓冲液:取7.50 g甘氨酸溶解于800 mL去离子水中,用1 mol/L氢氧化钠溶液调节pH至9.0~11.0,定容至1 L。

1.2 易错PCR突变和表达

将实验室保藏的菌株Escherichia coli DH5α-pAOhr-ManB扩大化培养,使用试剂盒提取质粒pAOhr-ManB作为模板,扩增甘露聚糖酶的基因,以回收的片段为模板,进行易错PCR。所用的引物序列见表1。

易錯PCR通过改变体系中锰离子浓度和4种脱氧核糖核苷酸的浓度比例,使甘露聚糖酶的碱基序列发生随机突变,从而得到多个甘露聚糖酶ManB的突变基因序列。易错PCR的操作体系见表2。基因扩增、大肠杆菌表达和蛋白质提纯方法见参考文献[9,10]。

1.3 酶学性质检测

原酶及突变酶最适温度测定[11]:采用3,5-二硝基水杨酸方法(简称DNS法)对原酶及突变酶的最适温度进行测定,以0.5%角豆胶为底物,在pH 7.0反应条件下,分别测定不同温度梯度(50~85 ℃)下的酶活力,酶活力最高点为最适反应温度,以测得的最大酶活值为100%,计算不同温度下的相对酶活力,每个反应设置3个平行。

差示扫描荧光定量(Differential scanning fluorometry, DSF)测定[12]:检测不同重组酶蛋白的表观解链温度即Tm。DSF试验只需要少量纯化的蛋白质(10~25 μL),其最低蛋白质浓度为0.1~0.3 mg/mL,将蛋白质和荧光染料均匀混合加入96孔板中,再放入实时荧光定量PCR仪中,可以在较短时间内完成测量过程,这些特点使DSF方法可以快速测量蛋白质的热稳定性。将20 μL纯化后的不同酶蛋白质与5 μL的100×SYPRO Orange染料混合离心,设置实时荧光定量PCR系统中以0.1 ℃的增幅从30 ℃到99 ℃加热样品,并同时测得其荧光值,根据荧光值的变化来测定重组酶的Tm。

2 结果与分析

2.1 甘露聚糖酶突变株基因的获得和表达

本实验室保藏的甘露聚糖酶(PDB:1BQC)基因来源于Thermobifida fusca,在不改变氨基酸序列的情况下,对该酶基因序列进行序列重排与密码子优化。为了便于对该基因进行分子操作,消除了基因序列中的限制性内切酶位点,合成了一个新基因ManB(KJ806638)。同时在甘露聚糖酶ManB基因的两端分别设计添加酶切位点Nco I和Xho I,交由武汉擎科生物科技有限公司完成全基因合成,获得重组载体pAOhr-ManB。以pAOhr-ManB质粒作为模板,设计引物,通过使用Taq酶和改变PCR体系中的Mn2+浓度和4种脱氧核糖核苷酸的浓度比例,使甘露聚糖酶的碱基序列发生随机突变,从而得到多个甘露聚糖酶ManB的突变基因序列。本研究筛选获得的突变酶氨基酸序列信息如下(突变位点为N16I):

MATGLHVKNGRLYEAIGQEFIIRGVSHPHNWYPQHTQAFADIKSHGANTVRVVLSNGVRWSKNGPSDVANVISLCKQNRLICMLEVHDTTGYGEQSGASTLDQAVDYWIELKSVLQGEEDYVLINIGNEPYGNDSATVAAWATDTSAAIQRLRAAGFEHTLVVDAPNWGQDWTNTMRNNADQVYASDPTGNTVFSIHMYGVYSQASTITSYLEHFVNAGLPLIIGEFGHDHSDGNPDEDTIMAEAERLKLGYIGWSWSGNGGGVEYLDMVYNFDGDNLSPWGERIFYGPNGIASTAKEAVIFGLEHHHH

HH

采用限制性内切酶EcoR I和Not I完成甘露聚糖酶突变株N16I的基因和分泌型表达载体pET-22b(+)双酶切,再使用T4连接酶将两者连接,构建重组表达质粒。将该重组表达质粒转化大肠杆菌BL21感受态细胞,以PCR验证法筛选出阳性克隆菌株,并测序验证。验证正确后发酵产酶,纯化得到酶蛋白。目标甘露聚糖酶ManB的三维结构如图1所示。

2.2 甘露聚糖酶的性质分析

2.2.1 甘露聚糖酶最适温度的测定 由图2可知,以0.5%角豆胶为底物,在pH 7.0和反应时间10 min的条件下,原甘露聚糖酶ManB的最适反应温度在72.5 ℃左右,而同样条件下突变体酶的最适反应温度为77.5 ℃,显示出突变酶的最适反应温度明显提高。

2.2.2 甘露聚糖酶的热稳定性分析 由图3可知,甘露聚糖酶ManB和其突变体均具有较好的耐热性,在65 ℃处理30 min后仍无灭活现象。突变酶在70 ℃条件下处理后的残余酶活力高于原酶,显示出突变酶的耐热性能明显提高。

2.2.3 甘露聚糖酶Tm的测定 根据荧光值的变化来测定原酶和突变酶的Tm如图4所示。由图4可知,酶蛋白质的表观解链温度Tm从原酶的61.9 ℃提升到突变酶的 63.2 ℃。测定结果进一步证实了突变酶的耐热性提高。

3 小结

本研究将Thermobifida fusca来源的β-甘露聚糖酶ManB在大肠杆菌BL21中进行了异源表达,并通过易错PCR技术对该酶的基因序列进行了两轮易错PCR,得到突变体文库。通过筛选获得了一株性能较好的突变甘露聚糖酶N16I,并对其酶学性质进行了分析,其耐热性得到了提升[13-15]。本研究为甘露聚糖酶的分子改造和生产提供了一定的依据和基础。

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