黄海水产研究所研制出基因芯“黄海芯1号”助力对虾育种

基因芯片是提升育种效率、培育抗病、抗逆及优质等新品种的重要分子工具。近年来，针对对虾基因组育种缺乏低成本、高通量的基因芯片现状，中国水产科学研究院黄海水产研究所孔杰研究员团队研制出40K SNP基因芯片“黄海芯1号”。依据多代系谱，采用一步法基因组选择技术，“黄海芯1号”已经应用于对虾的商业化育种中，在提高致急性肝胰腺坏死病副溶血弧菌(VpAHPND)、白斑综合征病毒(WSSV)抗性和生长速度等方面取得显著进展。

研究团队对世界上重要的对虾养殖群体和品系进行了全基因组重测序，获得6百万个有效SNP标记，经过整合WSSV抗性、氨氮耐受性、饲料转化效率等相关SNP位点，选留45 815个标记并构建了液相芯片。利用该芯片的基因型检测结果，对VpAHPND和WSSV侵染的抗性开展一步法基因组选择，准确性比传统的BLUP方法高29%～91%。该团队已经与石家庄博瑞迪生物技术有限公司签约，联合开展育种技术服务与SNP基因型检测服务。目前，“黄海芯1号”已推广应用于4个凡纳滨对虾的遗传育种项目，分型个体数量超过2 000尾。

对虾40K SNP育种芯片“黄海芯1号”的研发，为凡纳滨对虾基因组亲缘关系鉴定、遗传结构与遗传多样性分析、多性状基因组选择等提供了重要工具，对进一步推动对虾种业的快速发展起到至关重要的作用。