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鸡L-FABP启动子区C/EBPα结合位点的定点突变分析

时间:2024-07-28

贺 綦,孙婴宁,李 辉*,王启贵

(1.农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨 150030; 2.黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨 150030; 3.东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030; 4.重庆市畜牧科学院,重庆 402460)

鸡L-FABP启动子区C/EBPα结合位点的定点突变分析

贺 綦1,2,3,孙婴宁1,2,3,李 辉1,2,3*,王启贵1,2,4*

(1.农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨 150030; 2.黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨 150030; 3.东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030; 4.重庆市畜牧科学院,重庆 402460)

为进一步分析L-FABP启动子区域中的C/EBPα结合位点以确定其在L-FABP转录中的调控作用。本研究采用定点突变方法将L-FABP启动子区域中的C/EBPα结合位点进行有效突变。结果显示,C/EBPα外源过表达可以抑制L-FABP启动子活性,突变L-FABP启动子区域中C/EBPα结合位点后L-FABP的启动子活性明显升高。这些结果表明,鸡L-FABP基因受到C/EBPα基因负调控作用,且C/EBPα很可能通过与该位点结合参与L-FABP的转录调控,为进一步研究C/EBPα在L-FABP基因转录调控中的作用提供重要依据。

鸡;L-FABP基因;启动子;定点突变;C/EBPα基因

肝型脂肪酸结合蛋白(Liver-type fatty acid binding protein,L-FABP,FABP1)属于脂肪酸结合蛋白(Fatty acid binding protein,FABP)家族的成员之一,是一组低分子量(14~15 ku左右)可以结合长链脂肪酸的高保守性胞质蛋白。目前,对L-FABP的功能研究主要集中在人与小鼠上[1-2]。研究发现,L-FABP与不饱和脂肪酸的协同作用可有效促进细胞的生长和分化[2]。F.Schroeder等[3]研究发现,L-FABP基因的表达与胚胎干细胞的增殖分化密切相关。E.P.Newberry等[4]利用基因剔除模型研究显示,在长期禁食状态下,L-FABP基因剔除的小鼠肝对脂肪酸的摄入量少于野生型。

鸡L-FABP基因只在肝和小肠中表达[5],与哺乳动物L-FABP蛋白结构相似[6]。已经研究证实,PPAR元件、甾族调节元件SRE、C/EBPα和AP1等是人L-FABP基因启动子的重要顺式作用元件[7]。C/EBPα基因是第1个被证明在脂肪细胞分化过程中起到重要作用的转录因子。通过在3T3-Ll前脂肪细胞中研究发现脂肪细胞的分化过程中必须要有C/EBPα。在小鼠体内将C/EBPα基因干扰,发现小鼠的白色脂肪组织发育停滞[8]。本研究前期对鸡L-FABP启动子进行鉴定与分析,推测其启动子区存在1个C/EBPα结合位点,受到C/EBPα基因负调控作用[9]。

为进一步分析L-FABP启动子区域中C/EBPα结合位点的真实性和确切位置,本研究采用定点突变的方法对L-FABP启动子区域中的C/EBPα结合位点进行分析,为阐明C/EBPα在L-FABP基因转录调控中的作用奠定了基础。

1 材料与方法

1.1 试验材料

DMEM高糖培养基、Opti-MEM 培养基、胎牛血清购自Gibco公司;荧光素酶报告基因检测试剂盒(Dual-Luciferase®Reporter Assay System)、萤光素酶报告基因载体(pGL3-basic vector)、海肾荧光素酶报告基因载体(pRL-TK vector)购自Promega公司;质粒回收试剂盒购自Omiga公司;转染试剂LipofectamineTM2000购自Invitrogen公司;Fast Mutagenesis System购自北京全式金生物技术有限公司;C/EBPα真核表达载体和L-FABP(-2076/-20)质粒由本实验室保存;人肝癌细胞系(HEGP2)由东北农业大学生命学院惠赠。

1.2 试验方法

1.2.1 生物信息学分析 采用Mulan和TFSEARCH 软件对L-FABP(-2 076/-20)启动子区进行转录因子结合位点的预测分析。

1.2.2 定点突变重组体的构建 根据生物信息学分析结果对L-FABP启动子区域的C/EBPα结合位点进行定点突变,设计C/EBPα结合位点突变引物并命名为L-FABP-F-mC/EBPα和L-FABP-R-mC/EBPα(表1)。以pGL3-L-FABP(-2 076/-20)质粒为模板构建突变重组体L-FABP-mC/EBPα。定点突变参照Fast Mutagenesis System试剂说明书操作。PCR反应条件:95 ℃预变性5 min;然后95 ℃ 20 s,55 ℃ 20 s,72 ℃ 3 min,28个循环;72 ℃延伸5 min。

1.2.3 人肝癌细胞系细胞(HEGP2)的培养与转染 人肝癌细胞系(HEPG2)用含有浓度为100 U·mL-1青霉素和链霉素、10%胎牛血清的DMEM高糖培养基;在37 ℃,5% CO2条件下培养;0.25%胰酶消化液消化;2 d传代一次;细胞的转染使用LipofectamineTM2000转染试剂,按照试剂说明书进行操作。

表1 构建启动子突变体所用引物序列

Table 1 Primers used for promoter mutation

引物名称Primername引物序列(5′⁃3′)SequencesofprimerL⁃FABP⁃F⁃mC/EBPαCTGAGATTTGTCCGCATGCTCCCAATTGL⁃FABP⁃R⁃mC/EBPαGCGGACAAATCTCAGATTAAAGGAGGAG

1.2.4 转录因子对鸡L-FABP基因启动子活性影响 HEGP2细胞接种于12孔板中,待细胞生长至70%汇合时,将C/EBPα真核表达载体分别与鸡pGL3-L-FABP(-2 076/-20)和突变重组体pGL3-L-FABP-mC/EBPα启动子报告基因载体共转染HEGP2细胞作为试验组;pCMV-HA载体分别与鸡pGL3-L-FABP(-2 076/-20)和突变重组体pGL3-L-FABP-mC/EBPα启动子报告基因载体共转染HEGP2细胞作为对照组。海肾荧光素酶报告基因为内源参照。每孔细胞转染1 μg质粒(表达载体∶启动子报告基载体质量比为3∶2),0.01 μg的海肾对照质粒(PRL-PK)转染48 h,回收细胞,检测双报告基因荧光素酶活性。

1.2.5 数据分析 所有数据均为3次独立试验结果,采用SPSS13.0统计软件进行单因素方差分析与t检验。P<0.05为差异显著,P<0.01差异极显著。

2 结 果

2.1L-FABP启动子区域的C/EBPα结合位点分析

利用Mulan(http://mulan.dcode.org)和TFSEARCH(http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html)网站分析鸡L-FABP(-2 076/-20)启动子序列上转录因子C/EBPα结合位点,设置Threshold:85.0 point。结果发现,在鸡L-FABP(-2 076/-20)启动子序列区间存在1个C/EBPα结合位点。结合在L-FABP翻译起始位点上游-1 854/-1 841,结合序列为agatttgtcAAtat。两个软件预测结果一致。

2.2 定点突变重组体的构建与鉴定

以L-FABP基因启动子(-2 076/-20)质粒为模板,利用L-FABP-F-mC/EBPα:5′-CTGAGA-TTTGTCCGCATGCTCCCAATTG-3′,L-FABP-R-mC/EBPα:5′-GCGGACAAATCTCAGATTAA-AGGAGGAG-3′为引物,进行PCR扩增。得到一条约6 874 bp的特异性条带(图1),与预期的结果大小一致。菌液提交立菲公司进行测序(图2)。结果显示L-FABP-mC/EBPα启动子点突变载体构建成功。

2.3C/EBPα结合位点定点突变重组体的启动子活性分析

M.DNA相对分子质量标准;1.原质粒为模板点突变PCR产物;2.模板稀释10倍点突变PCR产物; 3.模板稀释100倍点突变PCR产物;4.模板稀释1 000倍点突变PCR产物M.Trans2K Plus П DNA marker(5 μL);1-4.PCR products of site-directed mutagenesis,plasmid as templates respectively diluted 10,100,1 000 times图1 C/EBPα结合位点突变重组体质粒的琼脂糖凝胶电泳Fig.1 Agarose gel electrophoresis analysis of the C/EBPα binding sites mutant

为检测C/EBPα结合位点的突变是否影响L-FABP启动子的活性,将L-FABP启动子突变体与C/EBPα表达质粒共转染HEPG2细胞。48 h后分别检测萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶的活性。结果表明:1)C/EBPα的外源过表达可以抑制野生型L-FABP的启动子活性(P=0.028 0)。2)突变L-FABP的启动子区C/EBPα结合位点,C/EBPα外源过表达后L-FABP的启动子活性增强(P=0.019 2)。3)突变型L-FABP与野生型L-FABP相比突变型L-FABP的启动子活性高于野生型L-FABP启动子活性(P=0.003 5)。4)外源过表达C/EBPα,突变型L-FABP启动子活性高于野生型L-FABP启动子活性(P=0.002 2)(图3)。这些结果说明,C/EBPα结合位点得到有效突变,也暗示了C/EBPα对L-FABP启动子活性的抑制效应是通过该结合位点发挥作用的。

3 讨 论

L-FABP基因对细胞内脂肪酸的转运、代谢、脂质合成及长链脂肪酸依赖性基因的调控具有重要作用[10-11]。笔者前期通过对鸡L-FABP多态性的研究发现,L-FABP基因可能是影响鸡脂肪性状的重要候选基因[12]。利用生物信息学软件对L-FABP的启动子区域进行分析,发现L-FABP的启动子区域含有C/EBPα等转录因子结合位点[13]。鸡L-FABP基因受到C/EBPα基因负调控作用,且突变L-FABP启动子区C/EBPα结合位点后失去对L-FABP启动子的抑制作用。

目前,大量研究证实C/EBPα蛋白对基因的转录调控是多层次多因子的复杂精细调控。其与多种蛋白因子相互协调,在脂肪细胞增殖分化、脂肪沉积、胚胎发育、机体能量代谢、免疫反应及多种疾病过程中发挥重要作用[14-16]。C/EBP基因序列在人和鸡之间高度保守[8,17]。在不同物种间C/EBPs家族都是具有重要生物学作用的功能基因[18-19]。C/EBPα能与Ap2、SCD1、GluT4、leptin等脂肪细胞特征的启动子位点相结合并激活其表达,而突变这些基因启动子区的C/EBPα结合位点,则C/EBPα对其无激活效应[20]。本研究的结果显示,C/EBPα外源过表达可以抑制L-FABP启动子活性,与笔者前期研究结果一致[9]。采用定点突变方法将L-FABP启动子区域中C/EBPα结合位点进行突变后,L-FABP的启动子活性明显升高。L-FABP突变体启动子与C/EBPα共转染至人肝癌细胞中,L-FABP突变体启动子活性显著增强。通过生物信息学分析显示鸡L-FABP基因启动子区存在多个PPARγ结合位点。丁宁[21]研究显示,鸡C/EBPα基因表达蛋白能够结合于PPARγ基因启动子区,并显著激活其转录。有报道显示,adipophilin、L-FABP、RegIA、Gob-4 和NGAL这5个基因是由PPARγ直接调控的靶基因[22],此外激活的PPARγ可诱导L-FABP的表达,从而有效地转运脂质并促进其代谢[23]。因此推测,这有可能是转染C/EBPα反而造成了L-FABP突变体启动子区域其它转录因子如PPARγ等的结合量相应升高进而促进了L-FABP突变体启动子活性,但该推测还需进一步研究验证。

下划线标示位置为预测C/EBPα结合序列,箭头标示位置为点突变位置,由AAT突变为CGCUnderline indicate the predicted C/EBPα sequence,arrow label position for the point mutation,by the AAT mutated into CGC图2 L-FABP启动子区点突变测序结果Fig.2 The sequencing of L-FABP promoter region site-directed mutagenesis

*表示差显著(P<0.05);**表示差异极显著(P<0.01)*.Means differ significantly(P<0.05);**.Means highly differ significantly(P<0.01)图3 定点突变技术分析鸡L-FABP基因启动子区C/EBPα结合位点对该基因转录调控的影响Fig.3 Mutation analysis of the function of C/EBPα binding site in the minimal L-FABP promoter region

L-FABP 是肝中唯一表达的脂肪酸结合蛋白,介导脂肪酸及多种疏水基团的转运。本研究使用人肝癌细胞系HEPG2作为试验材料探索L-FABP转录调控机制。由于L-FABP基因及转录因子C/EBPα在鸡和人肝中都有表达且L-FABP、C/EBPα基因氨基酸序列保守性很高,人肝组织中的环境与禽类肝所提供的环境相似,因此推测在人和鸡的L-FABP基因具有相同的调控机制,鸡L-FABP基因受到C/EBPα基因负调控作用,并且C/EBPα很可能通过与该位点结合参与L-FABP的转录调控。

[1] LOWE J B,BOGUSKI M S,SWEETSER D A,et al.Human liver fatty acid binding protein.Isolation of a full length cDNA and comparative sequence analyses of orthologous and paralogous proteins[J].JBiolChem,1985,260(6):3413-3417.

[2] SOROF S.Modulation of mitogenesis by liver fatty acid binding protein[J].CancerMetastasisRev,1994,13(3-4):317-336.

[3] SCHROEDER F,ATSHAVES B P,STARODUB O,et al.Expression of liver fatty acid binding protein alters growth and differentiation of embryonic stem cells[J].MolCellBiochem,2001,219(1-2):127-138.

[4] NEWBERRY E P,XIE Y,KENNEDY S,et al.Decreased hepatic triglyceride accumulation and altered fatty acid uptake in mice with deletion of the liver fatty acid-binding protein gene[J].JBiolChem,2003,278(51):51664-51672.

[5] 石 慧,王启贵 王宇祥,等.鸡L-FABP抗血清制备及组织表达特性分析[J].畜牧兽医学报,2008,39(11):1466-1469. SHI H,WANG Q G,WANG Y X,et al.Preparation of antiserums against chicken liver-type fatty acid binding protein (L-FABP) and tissue expression analyses of L-FABP[J].ActaVeterinariaetZootechnicaSinica,2008,39(11):1466-1469.(in Chinese)

[6] HE Y,YANG X,WANG H,et al.Solution-state molecular structure of apo and oleate-liganded liver fatty acid-binding protein[J].Biochemistry,2007,46(44):12543-12556.

[7] MURAI A,FURUSE M,KITAGUCHI K,et al.Characterization of critical factors influencing gene expression of two types of fatty acid-binding proteins(L-FABP and Lb-FABP) in the liver of birds[J].CompBiochemPhysiolAMolIntegrPhysiol,2009,154(2):216-223.

[8] 张爱朋,王守志,王启贵,等.鸡C/EBPα基因的多态性与生长和体组成性状的相关研究[J].农业生物技术学报,2010,18(4):746-752. ZHANG A P,WANG S Z,WANG Q G,et al.Polymorphisms ofC/EBPαgene associated with growth and body composition traits in chickens[J].JournalofAgriculturalBiotechnology,2010,18(4):746-752.(in Chinese)

[9] 贺 綦,史洪岩,王海霞,等.鸡转录因子C/EBPα、KLF2、KLF3、KLF7、PPARα对L-FABP启动子活性的影响[J].中国畜牧杂志,2014,50(17):13-17. HE Q,SHI H Y,WANG H X,et al.The transcriptional activity ofL-FABPpromoter regulated by transcription factors C/EBPα,KLF2,KLF3,KLF7 and PPARα in chicken[J].ChineseJournalofAnimalScience,2014,50(17):13-17.(in Chinese)

[10] TAN N S,SHAW N S,VINCKENBOSCH N,et al.Selective cooperation between fatty acid binding proteins and peroxisome proliferator-activated receptors in regulating transcription[J].MolCellBiol,2002,22(14):5114-5127.

[11] WOLFRUM C,BORRMANN C M,BORCHERS T,et al.Fatty acids and hypolipidemic drugs regulate peroxisome proliferator-activated receptors alpha-and gamma-mediated gene expression via liver fatty acid binding protein:a signaling path to the nucleus[J].ProcNatlAcadSciUSA,2001,98(5):2323-2328.

[12] 王启贵.鸡FABP基因克隆、表达特性及功能研究[D].哈尔滨:东北农业大学,2004. WANG Q G.Cloning,expression and function of chicken FABP genes[D].Harbin:Northeast Agricultural University,2004.(in Chinese)

[13] 高广亮,冷 丽,张会丰,等.鸡肝脏型脂肪酸结合蛋白基因启动子活性分析[J].中国兽医学报,2012,32(9):1344-1348. GAO G L,LENG L,ZHANG H F,et al.Activity analysis of chicken liver fatty binding protein gene promoter[J].ChineseJournalofVeterinaryScience,2012,32(9):1344-1348.(in Chinese)

[14] FAJAS L,FRUCHART J C,AUWERX J.Transcriptional control of adipogenesis[J].CurrOpinCellBiol,1998,10(2):165-173.

[15] 王 娉,王启贵,李 辉,等.鸡C/EBP-α基因表达载体的构建及抗血清制备[J].细胞与分子免疫学杂志 2007,23(10):978-981. WANG P,WANG Q G,LI H,et al.Expression vector construction of chicken C/EBP-α and preparation of antiserums against C/EBPα[J].ChineseJournalofCellularandMolecularImmunology,2007,23(10):978-981.(in Chinese)

[16] CONSTANCE C M,MORGAN J I T,UMEK R M.C/EBPalpha regulation of the growth-arrest-associated gene gadd45[J].MolCellBiol,1996,16(7):3878-3883.

[17] MCLNTOSH A L,ATSHAVES B P,HOSTETLER H A,et al.Liver type fatty acid binding protein(L-FABP) gene ablation reduces nuclear ligand distribution and peroxisome proliferator-activated receptor-alpha activity in cultured primary hepatocytes[J].ArchBiochemBiophys,2009,485(2):160-173.

[18] ZEILINGER S,EBNER A,MAROSITS T,et al.The hypocrea jecorina HAP 2/3/5 protein complex binds to the inverted CCAAT-box(ATTGG) within the cbh2(cellobiohydrolase II-gene) activating element[J].MolGenetGenomics, 2001,266(1):56-63.

[19] HYNES M J,DRAHT O W,DAVIS M A.Regulation of the acuF gene,encoding phosphoenolpyruvate carboxykinase in the filamentous fungus Aspergillus nidulans[J].JBacteriol, 2002,184(1):183-190.

[20] MACDOUGALD O A,LANE M D.Transcriptional regulation of gene expression during adipocyte differentiation[J].AnnuRevBiochem,1995(64):345-373.

[21] 丁 宁.鸡转录因子PPARγ及C/EBPα的转录调控研究[D].哈尔滨:东北农业大学,2010. DING N.The transcriptional regualation of chicken transcription factor PPAR and C/EBPα genes[D].Harbin:Northeast Agricultural University,2010.(in Chinese)

[22] 白明华,马红兵,王西京,等.PPARγ对人胰腺癌细胞中抑癌基因PTEN表达的影响[J].细胞与分子免疫学杂志,2008,24(7):717-720. BAI M H,MA H B,WANG X J,et al.Effects of activated PPARγ on the expression of PTEN gene in pancreatic cancer cells[J].ChineseJournalofCellularandMolecularImmunology,2008,24(7):717-720.(in Chinese)

[23] BERGER J,MOLLER D E.The mechanisms of action of PPARs[J].AnnuRevMed,2002,53:409-435.

(编辑 郭云雁)

Site Directed Mutagenesis forC/EBPαBinding Sites in ChickenL-FABPPromoter

HE Qi1,2,3,SUN Ying-ning1,2,3,LI Hui1,2,3*,WANG Qi-gui1,2,4*

(1.KeyLaboratoryofChickenGeneticsandBreeding,MinistryofAgriculture,Harbin150030,China; 2.KeyLaboratoryofAnimalGenetics,BreedingandReproduction,EducationDepartmentofHeilongjiangProvince,Harbin150030,China;3.CollegeofAnimalScienceandTechnology,NortheastAgriculturalUniversity,Harbin150030,China;4.ChongqingAcademyofAnimalScience,Chongqing402460,China)

In order to further determine theC/EBPαbinding site ofL-FABPand analyze its role in the regulation ofL-FABPtranscription,theC/EBPαbinding site inL-FABPpromoter was effectively mutated using site-directed mutagenesis in the current study.The results showed that the expression ofL-FABPwas significantly repressed byC/EBPα,but theL-FABPpromoter activity was significantly promoted after the mutation ofC/EBPαbinding site.In a conclusion,the expression ofL-FABPwas significantly repressed byC/EBPα,andC/EBPαprobably involved in the regulation ofL-FABPexpression through this binding site.These results will provide a foundation for further research on the regulatory mechanism and function of chickenC/EBPαonL-FABPgene.

chicken;L-FABPgene;promoter;site-directed mutagenesis;C/EBPαgene

10.11843/j.issn.0366-6964.2015.09.003

2014-11-21

国家自然科学基金(30972087);博士后研究人员落户黑龙江科研启动资助金(LBH-Q08131);重庆市现代农业人才培育工程(14401)

贺 綦(1988-),女,黑龙江哈尔滨人,硕士生,主要从事动物遗传育种与繁殖研究,E-mail:heqidongke@163.com

*通信作者:李 辉,博士,教授,主要从事动物遗传育种研究,E-mail:lihui@neau.edu.cn;王启贵,博士,教授,主要从事动物遗传育种研究,E-mail:wangqigui@hotmail.com

S831.2

A

0366-6964(2015)09-1496-06

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